《樱花大战》讲述了公元20世纪初，东京的地下黑暗势力“黑之巢会”开始复苏，巢会妖僧天海率领着四大黑暗天王，操纵着利用古代咒语生成的魔物——魔操机兵，在东京开始了大肆的破坏，扬言统治全世界。 为了对抗这些黑势力，打击黑之巢会的猖獗活动，以东京为中心进行对降魔迎击作战的帝国华击团·花组，秘密驾驶 着光武开始了讨伐黑暗之战。 由于队员间缺乏沟通。战斗虽然勉强能打赢，但总是不够理想。于是在太正12年的4月1日，新从海军士官学校毕业的大神一郎少尉被分配到帝国华击团花组，担任队长职务。