停泊在京都口的舞仙湾的一艘汽艇发生爆炸事故，造成一名身份不明的男性死亡。京都府警的科学搜查研究所，通常被称为科搜研的法医研究员，真理子（泽口靖子）们赶到现场。刑警土门（内藤刚志）们已经在现场展开了搜查。根据科搜研的调查，汽艇被安置了爆炸物，只要一开发动机，就会爆炸。这当中，因为土门的请求，在京都府警从事要人警卫，并即将在京都举行的环境峰会中担任警卫的望（黑谷友香）也在现场。望知道前年，美国要人要乘坐的游览船发生的爆炸事件，而土门觉得这次事件与前年的事件有关联。