《图书馆员》描述一个藏身在伦敦大都会公共图书馆中的古老组织的故事，他们以解决神秘事件、抵抗超自然势力的侵袭、从全球各地寻找拥有强大魔力的古物为己任。在过去10年内，Flynn Carsen（Noah Wyle）一直担任该组织的头面人物「图书馆员」。他负责收集和保护各种古物，避免它们落入坏人之手。可是现在的情况已与以前完全不同，就算Flynn再能干，「图书馆员」的工作也不可能继续由一个人独自承担。为了协助Flynn完成使命，图书馆从全球范围内雇佣了四名新成员：训练有素的反恐专家Eve Baird（Rebecca Romijn），她的职责是保护这个团队的安全，确保他们能活着完成每一项任务；来自俄克拉荷马州的石油工人Jake Stone（Christian Kane），智商高达190，大脑中就像装着一本艺术史的百科全书；性格古怪的年轻女人Cassandra（Lindy Booth），在听觉和「感知幻觉」方面有天赋，拥有「记忆提取」能力——也就是人们常说的「联觉」（synesthesia）现象；新技术专家Jones（John Kim），不仅迷恋各种尖端科技，也迷恋经典的罪案故事，他很享受在神秘事件中担当一个「国际人」。坏脾气的Jenkins（John Larroquette）负责监管这个团队的工作，他是个古代传说的专家，对神学、玄学和神秘学了如指掌。几乎没有人认识他……因为他长期在图书馆之外工作。这个团队有许多可怕的敌人，其中最主要的对手是「毒蛇兄弟会」（Serpent Brotherhood）。这是一个由神秘的不死之人Dulaque（Matt Frewer）领导的古老邪教组织。